Sens dubte, una de les principals vies de comunicació en el departament de el Va xocar és el Rio Atrato, un dels més cabalosos de l'món i dels que ofereix més navegabilitat.
La seva extensió és de 750 km i la seva navegabilitat de 500 km, neix al turó Platejat, a la serralada Occidental , segueix un curs sud-nord entre aquesta serralada i la regió muntanyenca del Baudó, a través d'una vall massa humida, la qual l'ha afavorit granment com a via de comunicació, per desembocar Antioquia.
Entre els molts afluents, els més destacats són: el Riosucio, el Murri, l'Arquia i el Truandó. El seu principal port és Quibdó. La foia del riu Atrato, l'extensió del qual és de 35.000 km és rica en or, fustes i és també una regió molt fèrtil.
El riu Atrato travessa el Parc Nacional dels Katíos, fa part de l'xocar biogeogràfic, considerada la zona amb més biodiversitat de la planeta i una de les més plujoses, d'aquí l'alt cabal que mostra aquest riu.